《表1 实验所用引物及其序列》

《表1 实验所用引物及其序列》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《中华绒螯蟹胰脂酶基因克隆及表达分析》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

本研究以反转获得的中华绒螯蟹肝胰腺cDNA为模板,利用特异性引物F1和R1(表1)扩增获得了中华绒螯蟹胰脂酶基因序列片段,共850 bp。3'RACE扩增获得了1 099 bp的3'端序列片段。5'RACE采用巢式PCR进行,其5'GSP-1扩增产物长度约为1 100 bp,二次PCR扩增后获得了953 bp的5'端片段。通过对上述序列进行拼接后,本研究得到一条长为1 970 bp的中华绒螯蟹胰脂酶基因cDNA序列(GenBank登录号:MG456862)。对中华绒螯蟹胰脂酶序列进行分析表明,该基因序列开放阅读框(ORF)长度为1 374 bp,共编码457个氨基酸,5'和3'非编码区(UTR)长度分别为372 bp和224 bp。对中华绒螯蟹胰脂酶基因的理化分析表明,中华绒螯蟹胰脂酶包含457个氨基酸,其中天冬氨酸(Asp)含量最高为9.4%,其次为含量9.0%的亮氨酸(Leu)。预测分子量为51.066 kD,理论等电点为4.65。该蛋白质不稳定系数为30.72,属于稳定蛋白,脂肪族氨基酸指数为80.90。通过NCBI蛋白质Blast对中华绒螯蟹胰脂酶氨基酸序列进行分析(图1)的结果表明,在117 aa、140 aa和225 aa处检测到了脂肪酶特征性的催化三联体S-D-H(Ser-AspHis);在200~202 aa和222~223 aa处预测到了脂肪酶活性位点“盖子(Flap)”结构;115~119 aa处预测到了脂肪酶特性的“亲核弯”结构。