《表3 不同sgRNAs对CsLOB1G和CsLOB1-结合能力分析》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《CRISPR/Cas9介导柑橘CsLOB1基因启动子的多位点编辑》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

‘晚锦橙’基因组中CsLOB1启动子含有两种类型CsLOB1G和CsLOB1-。为了分析sg RNA1、sgRNA2和sgRNA3对两种类型启动子结合能力的差异，对17个pCas9CsLOB1:2sites和15个pCas9CsLOB1:2sites转基因株系进行CsLOB1G和CsLOB1-突变率的统计。在680个pCas9CsLOB1:2sites转基因株系的单克隆中，有172个克隆发生sg RNA1位点突变（25.3%），其中135个为CsLOB1G突变（19.9%），37个为CsLOB1-突变（5.4%）；有125个克隆发生了sg RNA3位点突变（18.4%），突变都发生在CsLOB1G启动子上（表3）。这些结果说明sg RNA1可以识别CsLOB1G和CsLOB1-，由于‘晚锦橙’基因组中CsLOB1G与CsLOB1-的比例大概为3︰1（Peng et al.，2017），因而sgRNA1对CsLOB1G与CsLOB1-的结合效率差异不大。sgRNA3仅能识别和结合CsLOB1G，而不能识别和结合CsLOB1-。pCas9CsLOB1:3sites含有sg RNA1、sgRNA2和sgRNA3。对600个单克隆测序结果进行分析，有85个克隆发生了sgRNA1靶位点突变（14.2%），其中71个CsLOB1G突变（11.8%），14个CsLOB1-突变（2.4%）；有77个sgRNA2位点突变（12.8%），其中CsLOB1G突变率为11.7%，CsLOB1-突变率为1.1%；有57个克隆发生sgRNA3位点突变（9.5%），都为CsLOB1G突变（表3）。这些结果说明sgRNA1、sg RNA2具有识别CsLOB1G与CsLOB1-的能力，但sg RNA1，sgRNA2对CsLOB1-结合能力存在差异。在pCas9CsLOB1:3sites转基因植株中，sg RNA3也仅能识别和结合CsLOB1G启动子。