《表1 本研究使用的引物:意大利蜜蜂幼虫肠道在球囊菌侵染前期的差异表达microRNA及其调控网络》

《表1 本研究使用的引物:意大利蜜蜂幼虫肠道在球囊菌侵染前期的差异表达microRNA及其调控网络》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《意大利蜜蜂幼虫肠道在球囊菌侵染前期的差异表达microRNA及其调控网络》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

通过Stem-loop RT-qPCR检测4个随机选取的mi RNA(novel-m0031-3p、novel-m0034-5p、mi R-3793-x和ame-mi R-6000a-5p)在Am CK和Am T中的表达情况,以验证s RNA-seq数据的可靠性。根据所选mi RNA的序列,参照CHEN等[20]的方法,利用DNAMAN软件(Lynnon Biosoft公司,美国)设计特异性的Stem-loop引物、上游引物和通用的反向引物,委托上海生工生物工程有限公司进行引物合成。选择snRNA U6作为内参。利用RNA抽提试剂盒(Axygen公司,美国)分别提取AmCK和AmT的总RNA,利用Stem-loop引物进行反转录得到相应的c DNA作为模板进行PCR和q PCR。常规PCR体系为50μL,包括PCR mix(Ta Ka Ra公司,日本)25μL、无菌水17.5μL、正、反向引物及c DNA模板各2.5μL。反应程序如下:95℃5 min,95℃30 s,50℃30 s,72℃1 min,34个循环,72℃5min。随后利用1.8%的琼脂糖凝胶电泳检测PCR的产物。qPCR反应体系(20μL):SYBR Green Dye 10μL,正、反向引物各1μL,c DNA模板1μL,Rox 0.44μL,DEPC水补至20μL。在ABI 7500荧光定量PCR仪(ABI公司,美国)中进行反应,反应条件:95℃1 min,95℃15 s,49—60℃60 s,共40个循环,熔解曲线默认系统程序。所选mi RNA的相对表达量采用2-ΔΔCt法计算。每个反应进行3次生物学重复和3次技术重复。最后利用GraphPad Prism 5软件进行qPCR结果的检验及绘图。本研究使用的引物序列信息详见表1。