《表1 本研究使用的引物:意大利蜜蜂幼虫肠道在球囊菌胁迫后期的差异表达微小RNA及其靶基因分析》

《表1 本研究使用的引物:意大利蜜蜂幼虫肠道在球囊菌胁迫后期的差异表达微小RNA及其靶基因分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《意大利蜜蜂幼虫肠道在球囊菌胁迫后期的差异表达微小RNA及其靶基因分析》


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根据DEmiRNAs的序列信息,利用DNAMAN软件设计stem-loop引物、正向引物和通用反向引物,并委托上海生工生物工程公司合成相关引物。本研究使用引物信息详见表1。利用RNA抽提试剂盒(Axygen公司,美国)分别提取Am CK和Am T的总RNA,利用stem-loop引物进行反转录获得相应的cDNA模板。常规PCR体系为20μL:PCR mix(TaKaRa公司,日本)10μL,无菌水7μL,上下游引物(1.67μmol/L)及cDNA模板各1μL。反应程序:95℃3 min;95℃30 s,49℃30 s,72℃1 min,34个循环;72℃5 min。PCR的产物经1.8%的琼脂糖凝胶电泳检测。qPCR检测采用SYBR Green法在ABI QuantStudio 3荧光定量PCR系统(ABI公司,美国)中进行,反应体系为20μL:SYBR Green Dye 10μL,上下游引物(1.67μmol/L)以及cDNA模板各1μL,Rox 0.44μL,DEPC水补至20μL。反应条件:95℃预变性1 min;95℃变性15 s,49℃延伸30 s,40个循环;最后72℃延伸45 s。以U6作为内参,所选mi RNAs的相对表达量采用2-ΔΔCt公式进行计算。对每个生物学重复样品进行3次技术重复。最后通过Graph Prism 5软件对DEmiRNA的qPCR结果和s RNA-seq结果进行绘图。