《表1 本研究使用的引物:蜜蜂球囊菌菌丝和孢子中微小RNA及其靶mRNA的比较分析》
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《蜜蜂球囊菌菌丝和孢子中微小RNA及其靶mRNA的比较分析》
随机选取5个DEmiRNA(miR5658-x、mi R-10285-y、miR-3245-y、miR4404-x、mi R-9-z)进行Stem-loop RT-qPCR验证。参照CHEN等[33]和郭睿等[34]的方法,利用DNAMAN软件(Lynnon Biosoft公司,美国)设计上述DEmiRNA的Stem-loop引物、特异性上游引物和通用下游引物。委托上海生工生物工程股份有限公司合成引物(表1)。利用总RNA抽提试剂盒(Promega公司,中国)分别抽提菌丝和孢子的总RNA,然后用RNase-free DNase I去除各自基因组DNA残留。吸取1μL RNA,用NanoDrop One(Thermo Scientific公司,美国)分别对菌丝、孢子的RNA浓度进行测定。利用Stem-loop引物,按照cDNA第1链合成试剂盒(TaKaRa公司,日本)说明书进行总RNA的反转录,得到的c DNA作为模板进行qPCR。选用球囊菌的actin(5417)作为内参基因。反应体系为20μL:SYBR Green Dye 10μL,特异性上游引物1μL,通用下游引物1μL,c DNA模板1μL,RNA-Free H2O 7μL。每个反应进行3次技术重复。采用2-ΔΔCt法计算DEmiRNA的相对表达量,然后利用GraphPad Prism 7软件进行Student’s t-test检验及绘图。
图表编号 | XD00160733600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.01 |
作者 | 陈华枝、祝智威、蒋海宾、王杰、范元婵、范小雪、万洁琦、卢家轩、熊翠玲、郑燕珍、付中民、陈大福、郭睿 |
绘制单位 | 福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院) |
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