《表1 各数据库基本信息:图核结合神经网络的蛋白质分类方法》

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《图核结合神经网络的蛋白质分类方法》


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数据库是由PDB提供的公开数据集,图结构数据包含D&D、ENZYMES、NCI1、NCI2和MUTAG数据库。EN-ZYMES是一个具有三层结构的蛋白质数据集,其包含从酶蛋白质数据库中获取的600个蛋白质酶,在该情况下的主要任务是给每个蛋白质正确添加一个6层结构的类。D&D是一个包含1178个蛋白质结构的数据集,每个蛋白质可看作一个图,图中节点表示氨基酸,两个节点之间的边小于6埃则可用一条边连接。各数据库基本信息如表1所示。