《表1 各物种的LEC2蛋白序列基本信息》
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《亚麻荠油脂相关转录因子CsLEC2基因家族的鉴定及表达分析》
以拟南芥At LEC2蛋白序列(NCBI登录号为NP_564304.1)为参考序列,在亚麻荠基因组数据库中进行BLASTP搜索,发现Cs LEC2有3条同源蛋白序列(Csa03g031590.1、Csa14g035910.1和Csa17g039140.1),下载3条Cs LEC2蛋白序列。采用保守结构域数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/docs/cdd_search.html)、SMART(http://smart.embl-heidelberg.de/)和Pfam(http://pfam.xfam.org/)鉴定上述编码蛋白的功能结构域。根据染色体分布,将3条蛋白序列分别命名为Cs LEC2.1(Csa03g031590.1)、Cs LEC2.2(Csa14g035910.1)和Cs LEC2.3(Csa17g039140.1)。在NCBI数据库中用Cs LEC2蛋白序列Protein BLAST,下载其他物种的LEC2蛋白序列(表1)。
图表编号 | XD00218053600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.15 |
作者 | 王志龙、薛应红、郝月茹、刘宝玲、苑丽霞、薛金爱、李润植 |
绘制单位 | 山西农业大学分子农业与生物能源研究所、山西农业大学分子农业与生物能源研究所、山西农业大学分子农业与生物能源研究所、山西农业大学分子农业与生物能源研究所、晋中学院生物科学与技术学院、山西农业大学分子农业与生物能源研究所、山西农业大学分子农业与生物能源研究所 |
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