《表3 肝素异构酶酶学性质表》

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《肝素C5异构酶的表达优化及分子改造》


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根据已报道的酶晶体结构分析,经分子对接,选择距离底物结合口袋5?范围内的氨基酸位点,以pColdⅢ-SET2-C5为模板,对V153、D155、Q185、K397、G399、N478、D529、D545进行饱和突变。获得催化活性显著提高的突变体V153R,胞内上清酶液纯化后比酶活达到(145.14±2.33)U/mg。反应动力学常数显示其Km值由原来的(1.922±0.131)mmol/L降低至(0.941±0.083)mmol/L,催化常数kcat/Km由(16.129±0.111)增加至(44.633±0.547)L/(s·mol);突变体G399E Km值降低至(1.525±0.273)mmol/L,催化常数kcat/Km增加至(22.951±0.146)L/(s·mol)、D545Y Km值降低至(1.366±0.196)mmol/L,催化常数kcat/Km增加至(27.086±0.102)L/(s·mol),说明突变体与底物的亲和力增加。原因可能是由于底物带有较强的负电荷,当153位氨基酸由侧链不带电荷的缬氨酸变为带有正电荷的精氨酸时,异构酶底物结合口袋局部环境中的正电荷强度增加(如图4A、4B所示),且突变后(图4B)相比突变前(图4A),侧链更长,距离底物更近,底物更容易进入结合口袋;399位氨基酸突变前后如图4C、4D所示,突变前399位甘氨酸(图4C)与底物只有一个氢键作用力,突变为谷氨酸(图4D)后相比突变前氢键作用力增加,但同时底物结合口袋负电荷强度也增加;545位氨基酸突变前后如图4E、4F所示,突变前545位天冬氨酸(图4E)与底物没有作用,突变为酪氨酸后(图4F)与底物增加了疏水作用力,同时突变后底物结合口袋局部负电荷强度变弱,因此以上3个氨基酸位点可能发生多重作用力的叠加,导致催化活性呈现不同程度的提高。基于以上结果对153R、399E、545Y 3个单点突变体进行了两两叠加突变,并未发现明显效果(数据未展示)。