《表2 CE8s蛋白中的活性位点残基》

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《果胶甲酯酶的结构与功能研究进展》

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PME结构表面由较长的T2 loop区和T3 loop区形成裂缝，该裂缝的中心部分由几个芳香族氨基酸组成，这符合碳水化合物结合位点的特征[18]。Fries等[16]对欧文氏菌来源的PME（PDB ID:2NTB）与其底物共晶体的结构研究也进一步证实，六糖底物结合在酶表面的裂缝中。Teller等[8]分析了CE8s家族的PME的结构以及序列，总结了部分PME中的活性位点残基（表2）。以欧文氏菌来源的PME为例，酶与底物复合物的结构表明以下残基参与催化反应：Asp199、Asp178和Gln177（图5）。