《表4 MATK蛋白中的正选择氨基酸位点及其参数估测值》

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《40种蕨类植物matK基因的系统分类及分子进化研究》

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注:仅列入后验概率大于95%的正选择位点，估算结果以Na6ve empirical Bayes（NEB）分析为准。

本研究对蕨类植物4大类群25科40个物种的mat K基因数据集，估算了不同模型对应的对数似然值（ln L）和参数估测值。模型M2a（选择）、M5（γ）和M8（β和ω）均允许ω取值大于1，并通过估算寻找其位置（表4）。经LRT检验后发现，M2a和M8均比其对照模型更符合所分析的数据（表5），其原假设模型在显著性水平P=1%之下被极显著拒绝。