《表2 Rosetta-VIP计算设计突变位点及其能量、溶剂可及表面积和序列保守性》

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《基于多重计算设计策略提高枯草芽孢杆菌脂肪酶的热稳定性》

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利用Rosetta-VIP对枯草芽孢杆菌脂肪酶A结构进行分析，共计算设计出16个有利于结构空腔填充（ΔΔE<0）的单点突变，对其能量变化、溶剂可及表面积和序列保守性分析，如表2所示。ΔΔE值越小，表示设计的突变体比野生型越稳定，其中突变体F17A、F19W、L114P、I135V和I157L的ΔΔE<-5.0，预测这5个突变体热稳定性较高，其中I157L（ΔΔE=-9.57）是设计的16个突变体中能量降低最多的。同时，这5个突变体的ΔSASA<0，突变体中对应突变位点的溶剂可及表面积减少，更有利于蛋白的稳定，其中F17A的溶剂可及表面积是16个突变体中减少量最多的（ΔSASA=-90.33?2），F19W的溶剂可及表面积变化较小（ΔSASA=-0.21?2）。并且F19W没有出现在序列比对的500条同源序列中，不符合蛋白进化保守性，是不利突变的可能性大，其余4个点突变符合蛋白进化保守性。