《表3 Gab2-miRNA结合稳定性和特异性评分及miRNA不同物种间的序列保守性评分》
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《基于生物信息学分析和预测人骨肉瘤中Gab2靶向作用的miRNA分子》
利用miRanda软件对miRNA-Gab2进行热力学稳定性评分和序列保守性评分。Mir SVR score是蛋白与miRNAs结合的热力学评分,该评分越低表明蛋白和miRNAs靶向结合的概率越大,在miRanda软件中这个评分是判断靶向关系的十分重要依据。结果如表3所示,通过结果发现:miR-1236-3p和miR-218-5p与Gab2结合的热力学稳定性评分分别位于第一位和第二位,说明它们的结合稳定性和特异性均较高。PhastCons score是序列保守性评分,表示的是基因非翻译区在不同物种中的进化保守性强弱,该评分越高则表明序列保守性越强,蛋白和miRNAs靶向结合的概率越大。与Gab2结合的热力学稳定性评分较高的miR-1236-3p和miR-218-5p,它们的序列保守性评分也比较高,分别位于第二位和第六位,说明在不同物种间的序列保守性相对较高,结果如表3所示。这两个结果表明,miR-1236-3p和miR-218-5p与Gab2 3'UTR靶向结合的可能性较高,具有很好的特异性,进一步说明,Gab2可能是miR-1236-3p和miR-218-5p的靶基因。
图表编号 | XD0060986200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.28 |
作者 | 张蕊、吴启洋、刘纪明、郭晓仪、吴龙火 |
绘制单位 | 赣南医学院药学院制药工程教研室、赣南医学院、赣南医学院、赣南医学院、赣南医学院药学院制药工程教研室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |