《表3 特异性序列:MiRNAs在番茄钾营养胁迫中的作用》

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《MiRNAs在番茄钾营养胁迫中的作用》


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在该研究中,经原初reads质量过滤和插入15~30的片段去除来获得干净reads。样品JZ18CK、JZ18LK、JZ34CK、JZ34LK中分别获得了22 102 875、16 817 591、24 184 307、24 782 843条原初reads,经过去除低质量序列和污染reads,通过序列分析,4个样品分别获得958 194、855 836、1 014 229、975 668个独特的small RNA序列(表3)。这些sRNAs被注释成不同的类别。经过进一步去除rRNA、tRNA、snRNAs、snoRNAs、mRNA和重复区,miRNA分别获得56 940、56 251、64 464、56 754序列。此外,单一序列中的一大部分比例是未进行注释的sRNAs,说明了番茄在低钾胁迫过程中广泛存在新的miRNAs。