《表2 TFRs的配体与保守的DNA结合序列》

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《放线菌中与抗生素合成相关TetR家族转录因子的研究进展》


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TFRs与其作用靶点的结合受到一些小分子配体的调控,即TFRs与配体结合后改变其构象,增强或抑制其与靶基因的结合力,进而控制其靶基因的转录表达[7]。近年来研究发现,放线菌中与抗生素合成相关的TFRs主要应答γ-丁酸内酯类信号分子、ppGpp、GTP和抗生素及其生物合成中间体或前体(表2)。阿维链霉菌中AveR1和AveR2可以结合γ-丁酸内酯类信号分子,此外AveR2还能结合外源抗生素如杰多霉素B、安普霉素和潮霉素B[16-17];AveT则是应答阿维菌素B1生物合成的中间体C-5-O-B1[22]。地中海拟无枝酸菌(Amycolatopsis mediterranei)利福霉素生物合成基因簇中TFR RifQ与利福霉素形成了自反馈调控回路,调节胞内利福霉素的浓度[1]。天蓝色链霉菌XdhR结合ppGpp或GTP后减弱了其与靶基因启动子区的结合力[23]。在抗生链霉菌(Streptomyces antibioticus)chl基因簇中CHl F1不仅可以响应终产物氯丝霉素,还可以结合该抗生素生物合成的中间产物去甲基水杨酸-氯丝霉素(Demethylsalicycloylchlorothricin)和脱氯-氯丝霉素(Deschlorochlorothricin),从而调节胞内抗生素的浓度[28]。红色糖多孢菌PccD通过结合甲基丙二酸调控下游靶基因[15]。委内瑞拉链霉菌(Streptomyces venezuelae)JadR*和JadR2是杰多霉素生物合成基因簇中的两个调控因子,其中JadR*与2,3-脱氢-UWM6(2,3-Dehydro-UWM6,DHU)、脱氢腊伯罗霉素(Dehydrorabelomycin,DHR)结合形成前馈调控回路,通过及时供应辅因子FMNH2/FADH2使DHR转化为杰多霉素A,此外JadR*还可以应答杰多霉素B和杰多霉素A[26];而JadR2则是通过结合杰多霉素和氯霉素对这两种抗生素的生物合成进行交叉调控[44-45]。