《表2 不同物种c.346 G>A(p.G116S)突变位点同源序列比对》
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《GNB1基因突变致神经发育障碍患儿的临床及基因突变分析》
对患儿及其父母外周血DNA进行全外显子测序及生物信息学分析,发现患儿GNB1基因第7号外显子存在1个错义杂合突变c.346 G>A(p.G116S),患儿父母此位点为野生型。样本的有效读数、测序深度及覆盖度见表1。c.346 G>A(p.G116S)在不同物种间高度保守(表2),该突变位点在千人基因组、dbSNP、ExAC及gnomAD数据库中未见报道,Mutation Taster、SIFT、Polyphen-2及CADD预测软件均预测该变异是有害的,蛋白质结构预测软件Anthepro和Swiss-model提示c.346 G>A(p.G116S)影响蛋白质的二级结构,并使氢键断裂重排(图1)。该突变位点位于已报道的热点区域,异三聚体G蛋白三级结构模式图提示该突变位点位于G蛋白β亚基与α亚基的结合面(图2),因此该位点的突变可能会对蛋白质的结构及功能产生影响。参照ACMG 2015年分级标准,我们将GNB1基因的c.346 G>A杂合突变分级为可能致病性突变,变异证据为1个强证据(PS2),2个中等证据(PM1+PM2),3个辅助证据(PP2+PP3+PP4)。
图表编号 | XD00104437900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.15 |
作者 | 邵彬彬、乔凤昌、王陈、王艳、张菁菁、刘安、胡平、许争峰 |
绘制单位 | 南京医科大学附属妇产医院(南京市妇幼保健院)产前诊断科、南京医科大学附属妇产医院(南京市妇幼保健院)产前诊断科、南京医科大学附属妇产医院(南京市妇幼保健院)产前诊断科、南京医科大学附属妇产医院(南京市妇幼保健院)产前诊断科、南京医科大学附属妇产医院(南京市妇幼保健院)产前诊断科、南京医科大学附属妇产医院(南京市妇幼保健院)产前诊断科、南京医科大学附属妇产医院(南京市妇幼保健院)产前诊断科、南京医科大学附属妇产医院(南京市妇幼保健院)产前诊断科 |
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