《表3 Aru G与Arg S、Aru F与Arg N的蛋白序列同源性比对》

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《东湖假单胞菌HYS中的精氨酸琥珀酰转移酶途径缺失对秀丽隐杆线虫毒性的影响》


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将Arg N和Arg S的蛋白序列在NCBI中分别进行BLASTp比对,Arg N和Arg S均属于Ast A蛋白超家族,且Arg N属于精氨酸琥珀酰转移酶α家族蛋白。据文献报道,大肠杆菌E.coli中ast A对应铜绿假单胞菌PAO1中两个基因,分别是aru G和aru F[18],即精氨酸琥珀酰转移酶在大肠杆菌中以一个单独的蛋白形式存在,而在铜绿假单胞菌中对应两个基因分别编码两个蛋白亚基,aru G编码β亚基、aru F编码α亚基。HYS菌株中arg S和arg N与铜绿假单胞菌相似。Aru G与Arg S、Aru F与Arg N的蛋白序列相似度均达到85%以上,可初步推测HYS菌株中的arg N、arg S分别编码其精氨酸琥珀酰转移酶的α和β亚基(表3)。