《表3 东湖假单胞菌HYS中gac S相邻基因的蛋白同源性比对》

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《Gac系统中gacS基因的缺失对东湖假单胞菌HYS毒性的影响》

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为了更精准定位HYS中GacS蛋白的位置，需将PAO1基因组中的gacS核酸序列与表2中蛋白同源性最高的WP＿026001148.1的核酸序列以及相邻基因核酸序列进行比对分析。PAO1中GacS蛋白对应的gacS编码基因的编号为PA0928，HYS基因组中WP＿026001148.1蛋白编码基因的编号为UW3＿RS0101480。结果如图1所示，2个基因组中相同的颜色代表2个同源基因，而不同颜色代表基因组内不同的基因。可知P.donghuensis HYS中编号为UW3＿RS0101485的基因与P.aeruginosa PAO1中gacS基因所在位置的相邻基因排布一致（图1），且具有高度同源性（表3）。该结果说明UW3＿RS0101485基因即是PAO1中Gac系统关键的gacS基因的同源基因，由此可推测HYS中存在Gac系统。