《表3 SbWRKY蛋白与Os WRKY蛋白同源性比对》

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《高粱WRKY家族成员鉴定及生物信息学分析》


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本研究97个高粱SbWRKY蛋白与109个水稻Os WRKY蛋白进行同源性比对分析,比对到16个与Os WRKY蛋白同源率较高SbWRKY蛋白,属于Ⅰ类、Ⅱb、Ⅱd和Ⅲ类,分别有4个、6个、2个和4个。由于Ⅰ类是较原始的转录因子其变异小,不同物种间氨基酸序列保守度较高,所以Ⅰ类比对到的蛋白序列同源率较高且彼此相差不大。而Ⅱ和Ⅲ类WRKY转录因子的七肽保守域和锌指结构变异较大,所以SbWRKY和Os WRKY蛋白的同源率有高有低(表3)。此16个Os WRKY转录因子在水稻生长发育过程中的功能已经被验证,研究表明水稻Ⅰ类Os WRKY转录因子的功能主要与抗病相关,Ⅱb类则兼具抗病和抗逆多重功能,Ⅱd主要是调控植物的营养生长相关的功能,而Ⅲ类则兼具调控抗逆与营养生长等多种功能(郑超等,2018)。同源率较高的蛋白,其结构和保守基序具有较高的相似性,可能在植物生长发育过程中具有相似的功能。据此我们推测高粱Ⅰ类WRKY转录因子可能与抗病相关,Ⅱb类参与调控高粱的抗逆反应,Ⅱd参与调控植物的营养生长,而Ⅲ类调控抗逆与营养生长等。