《表1 Ci WRKY30及其同源WRKY蛋白氨基酸序列理化性质及亲疏水性分析》

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《中间锦鸡儿WRKY30的克隆及生物信息学分析》


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注:Ala:丙氨酸;Arg:精氨酸;Asn:天冬酰胺;Asp:天冬氨酸;Cys:半胱氨酸;Gln:谷氨酰胺

8种WRKY蛋白理化性质的预测(表1)采用ProtParam在线程序,结果表明,CcWRKY46,Gm W-RKY55,AtWRKY30,Os WRKY54,Vv WRKY46,TaW-RKY50,CsWRKY41与CiWRKY30均为不稳定蛋白。由预测的等电点可知,这些WRKY转录因子蛋白中酸性等电点居多,如CcWRKY46,Gm WRKY55,AtWRKY30,Os WRKY54,Vv WRKY46,CsWRKY41与CiWRKY30。而TaWRKY50为碱性蛋白。从蛋白组成可以看出CcWRKY46和AtWRKY30中天冬酰胺(Asn)含量最高,TaWRKY50中丙氨酸(Ala)含量最高,CsWRKY41中谷氨酰胺(Gln)含量最高,GmWR-KY55,Os WRKY54,Vv WRKY46与CiWRKY30天冬氨酸(Asp)最高。