《表1 中间锦鸡儿WRKY基因及其推导的蛋白的特点》

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《中间锦鸡儿WRKY蛋白与豆科等植物同源蛋白的比较分析》


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注:Mw:Molecular weight;AA:Amino acid length;*:引用Wan等.,2018

采用在线软件ProtParam对具有完整ORF的28个CiWRKYs蛋白的理化性质进行预测分析(表1)。28条CiWRKYs的等电点(isoelectric point,pI)各不相同,最高的为9.68,最低的为4.95,其中pI高于7的CiWRKYs有12个(表1)。通过比较蛋白中各氨基酸的组成发现(图1),p I大于9的蛋白,包括CiWRK-Y15、CiWRKY17和CiWRKY75-1中碱性氨基酸与酸性氨基酸的数量差值较大,分别达到了5.07%、3.54%和4.76%;相对应的,酸性与碱性氨基酸的差值较大还有CiWRKY30、CiWRKY41-1和CiWRK-Y70-1,而这3个CiWRKYs都属于GroupⅢ类,可能与其相应的功能有关。28个CiWRKYs蛋白的各氨基酸组成中(图1),含量最高的几乎都是丝氨酸(除CiWRKY56外),所占平均比例达到了12%;其中在CiWRKY33-1中丝氨酸含量最高,达到了15.99%,CiWRKY56中含量最低,为7.52%,仅次于亮氨酸(9.29%)和脯氨酸(7.96%)含量。所有CiWRKYs蛋白中含量少的氨基酸有半胱氨酸(0.94%~3.27%)、蛋氨酸(1.13%~3.88%)和色氨酸(0.29%~1.84%),平均含量相对比较稳定在5%左右的氨基酸是谷氨酸(4.42%~9.82%)和赖氨酸(3.99%~8.99%)。CiWRKYs的各个氨基酸的组成在各类Group和亚族之间没有发现明显的规律。