《表1 中间锦鸡儿WRKY基因及其推导的蛋白的特点》
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《中间锦鸡儿WRKY蛋白与豆科等植物同源蛋白的比较分析》
注:Mw:Molecular weight;AA:Amino acid length;*:引用Wan等.,2018
采用在线软件ProtParam对具有完整ORF的28个CiWRKYs蛋白的理化性质进行预测分析(表1)。28条CiWRKYs的等电点(isoelectric point,pI)各不相同,最高的为9.68,最低的为4.95,其中pI高于7的CiWRKYs有12个(表1)。通过比较蛋白中各氨基酸的组成发现(图1),p I大于9的蛋白,包括CiWRK-Y15、CiWRKY17和CiWRKY75-1中碱性氨基酸与酸性氨基酸的数量差值较大,分别达到了5.07%、3.54%和4.76%;相对应的,酸性与碱性氨基酸的差值较大还有CiWRKY30、CiWRKY41-1和CiWRK-Y70-1,而这3个CiWRKYs都属于GroupⅢ类,可能与其相应的功能有关。28个CiWRKYs蛋白的各氨基酸组成中(图1),含量最高的几乎都是丝氨酸(除CiWRKY56外),所占平均比例达到了12%;其中在CiWRKY33-1中丝氨酸含量最高,达到了15.99%,CiWRKY56中含量最低,为7.52%,仅次于亮氨酸(9.29%)和脯氨酸(7.96%)含量。所有CiWRKYs蛋白中含量少的氨基酸有半胱氨酸(0.94%~3.27%)、蛋氨酸(1.13%~3.88%)和色氨酸(0.29%~1.84%),平均含量相对比较稳定在5%左右的氨基酸是谷氨酸(4.42%~9.82%)和赖氨酸(3.99%~8.99%)。CiWRKYs的各个氨基酸的组成在各类Group和亚族之间没有发现明显的规律。
图表编号 | XD00103579400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.28 |
作者 | 万永青、万东莉、柳金华、王瑞刚、李国婧 |
绘制单位 | 内蒙古农业大学生命科学学院内蒙古自治区植物逆境生理与分子生物学重点实验室、中国农业科学院草原研究所农业部草地生态与修复治理重点实验室、内蒙古农业大学生命科学学院内蒙古自治区植物逆境生理与分子生物学重点实验室、内蒙古农业大学生命科学学院内蒙古自治区植物逆境生理与分子生物学重点实验室、内蒙古农业大学生命科学学院内蒙古自治区植物逆境生理与分子生物学重点实验室 |
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