《表4 同源比对涉及的蛋白序列及相关信息》
克隆得到的鸡GNAS基因的2种转录剪接体与人、小鼠、鸡等物种的蛋白同源性比对结果见图3和表4。从中可见,克隆子2编码的379个氨基酸(aa)序列与已知的人和小鼠的GNAS基因Gαs亚基同源相似度达93%,明显高于与XLαs亚基的同源性(相似度84%~87%)。克隆子1编码的417 aa序列与已知的人和小鼠的GNAS基因XLαs亚基同源性较高,相似度最高达87%(330/379 aa),与其他2条XLαs亚基的相似度为84%,这主要是因为这2条XLαs亚基中间多了一段15 aa序列,导致相似度降低;此外,虽然417 aa序列与2条Gαs亚基的相似度也达到87%,但二者相似氨基酸的数目要比XLαs亚基少7~8 aa(323/370 aa,322/370 aa)。经与NCBI数据库中4种预测的鸡GNAS基因蛋白亚基比较发现,417 aa序列与预测的X1亚基、379 aa序列与预测的X2亚基的同源相似度均达到100%,但这2种预测蛋白亚基对应的mRNA序列长度却在5 000 bp以上,远远大于克隆得到的剪接体长度。
图表编号 | XD00114224400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.25 |
作者 | 章学东、王欢欢、葛莹、宋丹丹、张雷、李庆海、楼立峰 |
绘制单位 | 杭州市农业科学研究院、杭州市农业科学研究院、杭州市农业科学研究院、杭州市农业科学研究院、杭州市农业科学研究院、杭州市农业科学研究院、杭州市农业科学研究院 |
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