《表3 RSVAs/Luohe.Henan与不同基因型代表株在每个蛋白基因的氨基酸同源性》

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《一株引起严重急性呼吸道感染病例的A亚型人呼吸道合胞病毒全基因组基因特征分析》

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36株病毒全基因组序列相比对发现，各个病毒之间的核苷酸同源性为92.69%～99.82%，氨基酸同源性为93.63%～99.67%。将RSVAs/Luohe.Henan与世界其他地区35条全基因组基于全基因组和每个蛋白基因分别比对发现，RSVAs/Luohe.Henan在全基因组和11个基因上都和ON1基因型的代表株病毒核苷酸和氨基酸同源性最高，其与2012年美国株RSVA/USA/05‐Dec‐2012（KJ672472）核苷酸序列同源性最高，为99.26%，而与美国2013年的病毒株RSVA/USA/11‐Jan‐2013（KJ672437）氨基酸序列同源性最高，为99.39%。基于各个蛋白基因和全基因组序列分别对RSVAs/Luohe.Henan与不同基因型代表株进行核苷酸和氨基酸同源性分析（表2，表3），结果发现，在基因组水平上，RSVAs/Luohe.Henan与4株ON1基因型病毒平均核苷酸（氨基酸）同源性最高，分别为99.33%和99.23%；而与4株GA1基因型序列平均核苷酸（氨基酸）同源性最低，分别为94.38%和93.50%。