《表1 不同物种HMOX1基因氨基酸序列的同源性分析》

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《合作猪HMOX1基因的克隆及生物信息学分析》

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NCBI数据库中检索得到野猪（NM＿001004027.1）、绵羊（XM＿027967703.1）、牛（NM＿001014912.1）、犬（NM＿001194969.1）、兔（XM＿002711415.3）、人（NM＿002133.3）、猫（XM＿003989222.5）、马（XM＿023631135.1）、小鼠（NM＿010442.2）、大鼠（NM＿012580.2）和鸡（NM＿205344.1）几个物种的氨基酸序列，与克隆得到的合作猪氨基酸序列用BLAST在线软件进行同源性比对，利用MEGA7.0软件中的P-distance模型计算各物种遗传距离（表1）并构建系统进化树（图3）。结果发现，克隆得到的合作猪该基因序列与野猪、绵羊、牛、犬、兔、人、猫、马、小鼠、大鼠和鸡的氨基酸同源性分别为99.3%、86.5%、85.5%、84.7%、84.0%、82.6%、82.6%、81.4%、78.9%、77.2%和61.5%。合作猪与野猪亲缘关系最近，与绵羊和牛的亲缘关系较近，与鸡的亲缘关系最远，符合实际情况。系统进化树分析结果与遗传距离分析结果相一致。