《表2 1F4抗体轻重链可变区基因同源性与氨基酸序列分析》
提取1F4细胞总RNA,经逆转录后通过特异性引物扩增出抗体轻重链可变区,琼脂糖电泳结果显示扩增目的片段均为420 bp左右,与预期的抗体轻重链可变区大小相符(图5)。扩增的目的片段连入T载体后测序,测序结果经IgBLAST比对分析后提取出抗体轻重链可变区的核苷酸序列,再经Vbase软件分析抗体轻重链可变区基因同源性与氨基酸序列。抗体可变区由FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4组成,Vbase软件分析了各框架区(FR)和互补决定区(CDR)长度(氨基酸残基数量);而且抗体CDR3是与抗原结合最重要的区域,其氨基酸序列在3个CDR中多样性最显著,所以重点分析了CDR3的氨基酸序列。结果见表2,抗体轻链可变区基因与小鼠IGκV3-12*01序列的同源性为98.2%,轻链可变区蛋白的4个FR(FR1、FR2、FR3、FR4)长度分别为26、17、36、10个氨基酸残基,夹在4个FR之间的3个CDR(CDR、CDR2、CDR3)长度分别为6、3、9个氨基酸残基,其中CDR3氨基酸序列为QQHYSTPWT;抗体重链可变区基因与小鼠IGHV1-5*01序列的同源性为96.9%,重链可变区蛋白的4个FR(FR1、FR2、FR3、FR4)长度分别为25、17、38、11个氨基酸残基,3个CDR(CDR1、CDR2、CDR3)长度分别为8、8、12个氨基酸残基,其中CDR3氨基酸序列为TRHGYFPSWFAY。
图表编号 | XD00137913100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.30 |
作者 | 许永亮、王佳星、李响、孙志杰、于海威、刘栋琦、张惟材、熊向华 |
绘制单位 | 辽宁大学生命科学学院、军事医学研究院生物工程研究所、军事医学研究院生物工程研究所、沈阳师范大学生命科学学院、辽宁大学生命科学学院、军事医学研究院生物工程研究所、辽宁大学生命科学学院、军事医学研究院生物工程研究所、军事医学研究院生物工程研究所、哈尔滨商业大学、军事医学研究院生物工程研究所、哈尔滨商业大学、军事医学研究院生物工程研究所、军事医学研究院生物工程研究所 |
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