《表2 不同物种间SUS氨基酸序列同源性比较》

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《铁棍山药SUS基因CDS区克隆与生物信息学分析》


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利用DNAman对所选物种的SUS氨基酸序列同源分析,见表2,该序列在所比对的物种间具有较高的保守性,序列相似性在79.29%~96.69%。DoSUS1与棕榈科油棕、海枣序列相似性分别为87.24%,86.50%;与凤梨科菠萝、芭蕉科香蕉、兰科白及、天门冬科芦笋的相似性分别为85.23%,84.31%,84.93%,84.66%;与同属植物参薯的相似性为81.84%;与禾本科植物大麦、水稻的相似性分别为80.74%,80.49%。这说明该基因在不同科属之间的演化过程中产生了不同程度的分化。使用MEGA7.0软件采用邻位连接法,并用Bootstrap方法检验拓扑结构,构建系统进化树。从系统发育树来看,DoSUS1与油棕、海枣、白及、芦笋、香蕉、菠萝、参薯等单子叶植物共聚为一支,接着又与番茄、胡萝卜、豌豆、拟南芥等双子叶植物聚为一支。见图7。