《表1 DoSUS1氨基酸序列组成》

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《铁棍山药SUS基因CDS区克隆与生物信息学分析》


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通过一级理化性质分析,DoSUS1编码序列全长2 448 bp,G+C含量45.10%,编码815个氨基酸,分子式C4209H6534N1115O1205S23,相对分子质量92 788.32,其中带负电荷残基总数占12.76%,带正电荷的残基总数占11.29%,见表1。在哺乳动物网织红细胞体内的半衰期为30 h,消光系数(λ=280 nm)为110 505 mol-1·cm-1,不稳定指数为32.18,属于稳定类蛋白;脂溶性指数(AI)为94.15,说明其稳定性好,平均亲水指数(GRAVY)为-0.225,属于可溶性蛋白;理论等电点(PI)6.10,为酸性蛋白质,说明在偏酸性的亚细胞环境中较稳定。信号肽与跨膜域预测显示,Do SUS1蛋白既不具有跨膜域,也不具有信号肽,提示DoSUS1为非分泌蛋白,因此DoSUS1蛋白在细胞中合成后可能不执行蛋白质转运的功能,而是在细胞质基质中发挥作用,这与其他物种的SUS成员特点一致。利用KinasePhos软件预测磷酸化位点并通过GENEDOC软件对序列进行修饰,所比对10个物种的单子叶植物SUS氨基酸序列均存在磷酸化位点苏氨酸(Thr),但其余磷酸化的氨基酸种类和位置有所不同,见图3。