《表3 基于ZJ2015全基因组核苷酸水平的同源性比对》

《表3 基于ZJ2015全基因组核苷酸水平的同源性比对》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《血清4型禽腺病毒浙江株的分离鉴定及其全基因组序列分析》


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利用Mega 6.06将ZJ2015全基因组(全长43 717 bp,GC含量54.87%)与不同血清型FAdV毒株进行遗传进化分析。结果显示:ZJ2015毒株处于C型FAdV分支上;在这个分支内,ZJ2015与近年来我国分离到的FAdV4型毒株亲缘关系更近,而与加拿大ON1(GU188428.1)、日本KR5(HE608152.1)、墨西哥MX-SHP95(KP295475.1)毒株亲缘关系较远(图5)。用MegAlign比对ZJ2015与FAdV4国外经典毒株及国内流行毒株的同源性显示,ZJ2015株与2015年以来国内流行的高致病力毒株的同源性在99.87%以上,与国外经典毒株略有差异,同源性在98.2%~99.0%之间(表3)。核酸序列分析显示,与国外毒株相比,ZJ2015及近年流行的FAdV4毒株的GA和TC重复区出现不同程度的缺失,且在基因组3.5×104~4.0×104bp位置处有一段长1 966 bp的基因片段缺失突变,这导致基因组中ORF19、ORF27、ORF48这3个编码蛋白的缺失。