《表1 2个先证者线粒体DNA全序列突变位点分析》

《表1 2个先证者线粒体DNA全序列突变位点分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《线粒体tRNA~(Tyr)A5834G突变与Leber遗传性视神经病变的相关性》


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注:a氨基酸或核苷酸在人(human,H)、牛(bovine,B)、小鼠(mouse,M)和爪蟾(Xenopus laevis,X)中的保守性;b见线粒体基因组数据库网站:http://www.mitomap.org和http://www.mitowheel.org/mitowheel.html。

PCR和测序分析结果显示2个家系所有成员和正常对照均未发现G3460A、G11778A和T14484C这3个原发突变位点。通过二代测序法对2个先证者进行线粒体全序列分析,结果如表1所示,2个先证者携带36个线粒体基因突变位点,分别位于D-loop区7个,12S r RNA 2个,16S r RNA2个,t RNA 1个,蛋白编码区24个,包含10个错义突变和14个同义突变,其中10个错义突变为:ND1基因G4084A(Val260Leu),MT-ND2基因G5460A(Ala331Thr),MT-CO2基因G7853A(Val90Ile),ATP6基因A8701G(Thr59Ala A)和A8860G(Thr112Ala),MT-ND3基因A10398G(Thr114Ala),MT-ND4基因G11696A(Val313Ile),MT-ND5基因T12811C(Tyr159His),MT-Cytb基因C14766T(Thr7Ile)和A15326G(Thr194Ala),其中ND4 G11696A已报道是与LHON相关的线粒体突变位点,其余变异位点通过对人、牛、小鼠、非洲爪蟾4个不同物种进行保守性分析,发现2个先证者同时携带的变异位点中A5834G和T12811C变异位点在进化上保守,通过进一步对17个不同物种mt DNA进行保守性分析,发现A5834G保守系数为87.5%(见图4),除T12811C在正常人突变频率较高外,其余变异位点均不保守,且均已报道可能与LHON的发病无关。同时2个家系中其他母系成员均携带A5834G突变,而104例正常对照和家系中非母系成员则不携带A5834G突变。根据东亚线粒体单体型系统进化树分析,这2个家系的mt DNA序列均属于东亚单体型M7b,已有研究证实M7b会加重LHON的临床表现[18]。