《表1 Gm GRF5蛋白的氨基酸含量》

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《大豆GmGRF5基因的组织表达模式与生物信息学分析》


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GmGRF5基因编码含有345个氨基酸的蛋白质,通过ExPASy-Protparam在线工具对GmGRF5蛋白的理化性质进行分析。结果显示该蛋白分子式为C1736H2639N505O551S14;相对分子量为39.463 48 kD,理论等电点8.307;富含强碱性氨基酸(Arg,Lys共39个);含有大量强酸性氨基酸(Asp,Glu共36个);蛋白质不稳定指数为56.66,为不稳定蛋白,且其脂肪系数为41.12。表中为氨基酸组成分析(表1),丝氨酸(Ser)、脯氨酸(Pro)、苏氨酸(Thr)、精氨酸(Arg)、谷氨酰胺(Gln)所占比例较高,分别为14.3%、8.6%、7.7%、7.2%、6.6%,色氨酸(Trp)和半胱氨酸(Cys)的占比最低,为1.4%。利用Protscale在线软件对GmGRF5蛋白的亲水性进行预测(图3),GmGRF5蛋白的氨基酸组成中大多为亲水性氨基酸,因此该蛋白为亲水性蛋白。综合上述分析结果,GmGRF5蛋白是一个亲水性的、不稳定的碱性蛋白。