《表1 Gm GRF5蛋白的氨基酸含量》
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《大豆GmGRF5基因的组织表达模式与生物信息学分析》
GmGRF5基因编码含有345个氨基酸的蛋白质,通过ExPASy-Protparam在线工具对GmGRF5蛋白的理化性质进行分析。结果显示该蛋白分子式为C1736H2639N505O551S14;相对分子量为39.463 48 kD,理论等电点8.307;富含强碱性氨基酸(Arg,Lys共39个);含有大量强酸性氨基酸(Asp,Glu共36个);蛋白质不稳定指数为56.66,为不稳定蛋白,且其脂肪系数为41.12。表中为氨基酸组成分析(表1),丝氨酸(Ser)、脯氨酸(Pro)、苏氨酸(Thr)、精氨酸(Arg)、谷氨酰胺(Gln)所占比例较高,分别为14.3%、8.6%、7.7%、7.2%、6.6%,色氨酸(Trp)和半胱氨酸(Cys)的占比最低,为1.4%。利用Protscale在线软件对GmGRF5蛋白的亲水性进行预测(图3),GmGRF5蛋白的氨基酸组成中大多为亲水性氨基酸,因此该蛋白为亲水性蛋白。综合上述分析结果,GmGRF5蛋白是一个亲水性的、不稳定的碱性蛋白。
图表编号 | XD00152807800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.03.14 |
作者 | 徐思远、刘志雄、张晓玫 |
绘制单位 | 长江大学园艺园林学院、长江大学园艺园林学院、中国农业科学院作物科学研究所国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程农业部北京大豆生物学重点实验室 |
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