《表2 Gm PYLs蛋白的保守motif氨基酸数量》

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《大豆脱落酸受体基因家族鉴定、系统发育进化及表达模式分析》

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由Gm PYLs基因家族的系统发育进化树（图2-A）可知，21个Gm PYLs基因可分为四大组（Ⅰ～Ⅳ），仅Ⅲ组中的5个Gm PYLs基因存在内含子，其他16个GmPYLs基因均无内含子（图2-B）。蛋白保守基序（motif）分析结果显示，从Gm PYLs和At PYLs蛋白中共鉴定出10个保守motif(motif 1～motif 10）（图2-C），长度为8～50个氨基酸（表2），其蛋白保守结构域的氨基酸序列分布情况如图2-D所示。所有Gm PYLs蛋白共有的motif为motif 1、motif 2和motif 3，与多序列比对分析结果（图3）一致。在同一组内系统发育进化树同一节支点的基因具有相似的保守motif结构（图2-A和图4）。结构域预测结果显示，21个GmPYLs蛋白均包含1个共有的聚酮环化酶结构域2(Pfam:Polyketide＿cyc2），部分Gm PYLs蛋白含有3个特有的结构域：聚酮环化酶结构域（Pfam:Polyketide＿cyc）、桦树花粉蛋白结构域（Pfam:Bet＿v＿1）和过氧化物酶结构域（Pfam:peroxidase）（图4和表3）。其中，Pfam:peroxidase是Gm PYL14蛋白所特有，说明其可能行使与其他Gm PYLs基因不同的生物学功能，如负责清除叶绿体和细胞质中的过氧化氢及其他氧化有毒化合物等。