《表2 pLP3质粒Rep蛋白Motifs保守序列的比对》

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《植物乳杆菌内源性质粒序列分析及其表达载体的构建》

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注：*.非保守性位点。

由植物乳杆菌质粒复制相关蛋白同源性的系统进化树可知，推测pLP3质粒属于植物乳杆菌编码Rep质粒家族1。Rep-1蛋白家族质粒和质粒pC194的Rep均含有3个保守的Motifs[22]，而且Motifs已被证明是pC194家族质粒复制起始的关键[23-24]。经过对pLP3质粒序列分析，发现该质粒的sso、dso位点以及Rep蛋白的Motifs与pC194家族的特征吻合（表2）。因此，推定pLP3的复制方式为滚环复制，属于pC194家族。