《表1 引物序列:蝴蝶兰一个C3型PEPC基因的克隆及其低温胁迫下的表达分析》

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《蝴蝶兰一个C3型PEPC基因的克隆及其低温胁迫下的表达分析》


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采用RNAprep Pure Plant Kit(天根)提取所有组织材料的总RNA,利用M-MLV反转录酶(TaKaRa)将低温处理3 d叶片的总RNA进行反转录为cD-NA;根据NCBI上已登录的PEPC基因序列设计1对简并引物PEPC-F1和PEPC-R1(表1),预期2 285 bp;利用上述cDNA和引物进行PCR扩增,扩增体系为20μL,含10×Buffer 2.0μL,每条引物0.5μmol/L,dNTP 600μmol/L,Taq DNA聚合酶1 U,cDNA模板1 000~2 000 ng。PCR扩增程序为:95℃变性5 min;95℃50 s,56℃50 s,72℃2 min,35个循环;72℃延伸10 min。凝胶回收目的片段,连接到pGEM-T Easy载体上,转入大肠杆菌DH5α感受态细胞,进行测序,得到目的基因的中间片段。根据得到的序列,分别设计1对5'端特异引物和1对3'端特异引物(表1),采用SMARTTMRACE Amplification Kit(Clontech)进行扩增,回收扩增产物,连接到pGEM-T Easy载体上,转入大肠杆菌DH5α感受态细胞,分别进行测序。将中间保守片段、5'端和3'端序列拼接得到蝴蝶兰PhPEPC基因的cDNA全长。在此基础上,在PhPEPC基因的编码区设计1对引物(表1),进行开放阅读框区域的PCR扩增,扩增体系和程序同前,对基因序列再次进行测序和验证。