《表1 建库所用引物列表》
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《利用ATAC-seq技术在人免疫细胞中检测染色质开放性的方法建立》
按每个样本需要50μL反应体系配制转座工作液,其中含2.5μL Tn5转座酶、25μL转座缓冲液和22.5μL无核酸酶纯水。使用转座工作液重悬细胞核样本,将其转移至恒温振荡器中,于37℃恒温孵育并振荡30min。转座反应完成后使用DNA纯化浓缩试剂盒纯化DNA样本,用10μL RSB洗脱DNA。将转座后DNA片段、HiFi PCR Master Mix以及建库用PCR引物(表1)配制成PCR反应体系。先运行5个PCR循环,取出一部分加入SYBR GreenⅠ染料和ROX染料进行实时定量PCR以确定剩余所需循环数。完成全部PCR循环后,使用Agencourt AMPure XP磁珠纯化并回收DNA,以25μL无核酸酶纯水洗脱建库后的DNA片段。
图表编号 | XD00138034900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.03.31 |
作者 | 欧阳也、秦玉婷、姚超、沈南 |
绘制单位 | 上海交通大学医学院附属仁济医院上海风湿病学研究所、上海交通大学医学院附属仁济医院上海风湿病学研究所、中国科学院上海营养与健康研究院、上海交通大学医学院附属仁济医院上海风湿病学研究所、中国科学院上海营养与健康研究院 |
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