《表1 q PCR所使用引物及扩增效率》
取L.plantarum 4-3菌株12、24、36、48 h发酵液进行RNA提取,使用UNIQ-10柱式Trizol总RNA抽提试剂盒(生工生物工程(上海)股份有限公司),使用反转录试剂盒HiScript II Q RT SuperMix for qPCR(南京诺唯赞生物科技有限公司)进行反转录,最后进行荧光实时定量PCR(quantitative PCR,qPCR)测定L.plantarum 4-3叶酸合成相关基因表达情况。qPCR所使用的引物均为本研究自行设计,具体序列信息见表1,使用ChamQTM SYBR qPCR Master Mix(南京诺唯赞生物科技有限公司)对反转录后的产物进行扩增,以16S rRNA基因为内参,每个样品做3个重复,经过梯度PCR测试。虽然每对引物溶解温度不完全一样,但在60℃退火温度条件下均能达到较好的扩增效率,因此扩增程序统一为:95℃预变性30 s,95℃变性10 s,60℃退火30 s,72℃复性30 s,扩增40个循环后置于4℃保存。qPCR结果用-ΔΔCt代表相对表达量,以MRS培养基中12 h样品各个基因表达量作对照。
图表编号 | XD00123344300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.25 |
作者 | 李强坤、柳陈坚、罗义勇、杨恩、李晓然 |
绘制单位 | 昆明理工大学生命科学与技术学院、昆明理工大学生命科学与技术学院、昆明理工大学生命科学与技术学院、昆明理工大学生命科学与技术学院、昆明理工大学生命科学与技术学院 |
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