《表1 RT-PCR扩增及测序所需引物》

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《A型塞尼卡病毒的分离鉴定及生物学特性研究》


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注:引物序列和位置参考株A型塞尼卡病毒(SVA)SVV-001序列(GenBank登录号:NC_011349)和FMDV O/BY/CHA/2010株序列(Gen-Bank登录号:JN998085.1)。Notes:Primer sequence and the position reference of SVA SVV-001strain sequence(GenBank accession number:NC_011349)an

参照A型塞尼卡病毒(SVA)SVV-001株序列(GenBank登录号:NC_011349)和口蹄疫病毒(Foot and mouth disease virus,FMDV)O/BY/CHA/2010株序列(GenBank登录号JN998085.1)设计引物(表1),由擎科泽西生物技术有限公司合成。以总RNA为模板进行反转录,反应体系为5×PrimeScript RT Master Mix 2μl,RNA模板1μl,添加RNase free水至总体积为10μl。PCR反应体系是5×Buffer 10μl,dNTP 4μl,上下游引物各2μl,反转录产物3μl,PrimeSTAR HS DNA Polymerase1μl,加无菌蒸馏水至总体积50μl。PCR扩增程序为:94℃预变性5min;94℃变性30s,58℃退火30s;72℃延伸1min,32个循环;72℃延伸10min。取8μl PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测,凝胶成像系统拍照观察。将阳性PCR产物送擎科泽西生物技术有限公司进行测序。