《表1 qRT-PCR引物信息》

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《核桃不定根发生阶段内参基因筛选与关键基因表达分析》


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根据桃(Tong et al.,2009)、大豆(Hu et al.,2009)、龙眼(Lin&Lai,2010)、黄瓜(Wan et al.,2010)和杨树(Xu et al.,2011)等物种内参基因的研究结果,选择8个常用的候选内参基因(表1):18S核糖体RNA 18S(18S rRNA)、肌动蛋白基因ACT(Actin)、肌动蛋白基因2 ACT2(Actin2)、微管蛋白基因TUB(Tubulin)、组蛋白基因H2B(Histone)、多聚泛素蛋白基因UBI(Polyubiquitin)、蛋白翻译延伸因子基因EF-2α(Elongation factor 2-alpha)和泛素蛋白基因UBQ(Ubiquitin),根据拟南芥(Xu et al.,2005;Chen et al.,2016)和杨树(Rigal et al.,2012;Leguéet al.,2014;Liu et al.,2014a;Xuan et al.,2014)等模式物种的相关研究,选择12个不定根发生相关基因(表2),通过与课题组前期插穗转录组数据进行blast分析,获得目的基因序列。引物设计使用Primer Premier 3.0在线工具,参数设定:退火温度(Annealing temperature,Tm)60℃,引物长度22~23 bp,扩增产物长度100~250 bp。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成引物列表见表2。