《表1 qRT-PCR引物信息》
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《核桃不定根发生阶段内参基因筛选与关键基因表达分析》
根据桃(Tong et al.,2009)、大豆(Hu et al.,2009)、龙眼(Lin&Lai,2010)、黄瓜(Wan et al.,2010)和杨树(Xu et al.,2011)等物种内参基因的研究结果,选择8个常用的候选内参基因(表1):18S核糖体RNA 18S(18S rRNA)、肌动蛋白基因ACT(Actin)、肌动蛋白基因2 ACT2(Actin2)、微管蛋白基因TUB(Tubulin)、组蛋白基因H2B(Histone)、多聚泛素蛋白基因UBI(Polyubiquitin)、蛋白翻译延伸因子基因EF-2α(Elongation factor 2-alpha)和泛素蛋白基因UBQ(Ubiquitin),根据拟南芥(Xu et al.,2005;Chen et al.,2016)和杨树(Rigal et al.,2012;Leguéet al.,2014;Liu et al.,2014a;Xuan et al.,2014)等模式物种的相关研究,选择12个不定根发生相关基因(表2),通过与课题组前期插穗转录组数据进行blast分析,获得目的基因序列。引物设计使用Primer Premier 3.0在线工具,参数设定:退火温度(Annealing temperature,Tm)60℃,引物长度22~23 bp,扩增产物长度100~250 bp。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成引物列表见表2。
图表编号 | XD00113570200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.25 |
作者 | 宋晓波、常英英、刘昊、徐慧敏、裴东 |
绘制单位 | 林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所、林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所、林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所、天津市林业果树研究所、河南省洛宁县林业局、林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所 |
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