《表1 候选内参基因的引物信息》
在NCBI的Genome Database中搜索“Candidatus Liberibacter asiaticus”,选择A4菌株(CP010804)的蛋白质信息。根据常用内参基因的功能注释[21],选择其中的管家基因作为候选内参基因(表1),其中包括已使用但未验证的内参基因gyrA[14]。根据选出的候选内参基因序列,在Primer3(http://p r i me r 3.u t.e e/)中设计引物。引物设计选择Nucleotide BLAST(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)结果中特异于CLas的序列,产物长度设置为80–100 bp,熔解温度设置为58.0-64.0°C[29],其余均为默认设置。每对引物通过NCBI PrimerBLAST(www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/)检验特异性,“Blast expect(E)value”设置为“1 000”,“Blast word size”设置为“16”。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,引物序列及相关信息如表1所示。表1中同时列出基于16S rRNA基因设计的CLas特异引物HLBas/HLBr[28]。
图表编号 | XD00112483900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.11.20 |
作者 | 郑永钦、郑正、陈燕玲、黄洪霞、许美容 |
绘制单位 | 华南农业大学柑橘黄龙病研究室广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室、华南农业大学柑橘黄龙病研究室广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室、华南农业大学柑橘黄龙病研究室广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室、华南农业大学柑橘黄龙病研究室广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室、华南农业大学柑橘黄龙病研究室广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室 |
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