《表1 候选内参基因引物信息》
注:EF1αH为已使用的连翘α延伸因子基因[17]。
根据连翘转录组测序获得的核酸序列,选择11个常用内参基因[16]作为候选:18S核糖体RNA(18S ribosomal RNA,18S)、60S核糖体RNA(60S ribosomal RNA,60S)、肌动蛋白7(Actin7,ACT7)、延伸因子1α家族(E-longation factor 1-α,EF1α)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)、组氨酸家族蛋白(Histone superfamily protein H3,HIS)、类脂质运转蛋白(Lipocalin-like,LIPL)、核糖体L27e蛋白家族(Ribosomal L27e protein familay,RP)、核糖体蛋白L17(Ribosomal protein L17,RPL17)、微管蛋白(Tubulin beta chain,TUB)和泛素蛋白家族(Ubiquitin family,UBQ);另外,选取转录组数据中变化微小的7个基因作为候选内参基因,分别命名为:FS-1、FS-2、FS-3、FS-4、FS-5、FS-6、FS-7;EF1αH为已验证的连翘内参基因[17]。根据RT-qPCR引物的设计原则,利用IDT PrimerQuest Tool分别设计19个候选内参基因的引物,具体信息列于表1。
图表编号 | XD00138867600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.03.20 |
作者 | 曹亚萍、王勇飞、贾孟君、贺嘉欣、张鑫瑞、李政、乔永刚、宋芸 |
绘制单位 | 山西农业大学生命科学学院、山西农业大学生命科学学院、山西农业大学生命科学学院、山西农业大学生命科学学院、山西农业大学生命科学学院、山西农业大学生命科学学院、山西农业大学生命科学学院、山西农业大学生命科学学院 |
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