《表2 CRISPR/Cas9系统脱靶位点分析与检测》

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《CRISPR/Cas9介导烟草多基因编辑体系的应用》


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由于与靶序列的相似,Cas9可能出现非特异性切割而发生脱靶现象。为了分析本文所构建的CRISPR/Cas9多基因编辑系统是否存在脱靶现象,我们将PCS1、eIF4E、TOM3、TOM1和HMA2基因的靶位点序列与烟草基因组数据进行了对比分析,根据((N)12NGG)的原则和PAM区上游序列(12 bp)决定靶位点特异性的原则[31,32],分别在烟草全基因组范围内各筛选了一个最有可能脱靶的候选位点,如表2所示,各基因靶位点从第8-10位点开始到PAM序列,完全与脱靶候选位点序列匹配。通过设计特异性引物,在5个基因都有突变的7株阳性植株中扩增候选脱靶位点的DNA片段,测序结果表明并未发现突变序列,这表明本实验所构建的CRISPR/Cas9系统具有较高的特异性。