《表3 酒曲样品细菌测序数据统计分析》

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《应用Illumina高通量测序技术分析3种酒曲中微生物多样性》

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除去不合格序列后，3种酒曲样品中共获得129 510条高质量细菌序列（表3），其中从酒曲A、B、C中分别获得45 308、40 940、43 262条有效序列，基于97%相似度其OTU数量分别为474、89和476。ACE指数在246.09～476.27之间，Shannon指数在1.64～4.42之间，Chao 1指数在139.65～477.67之间，覆盖率范围99.87%～99.97%。说明所测得的OTU基本能反映所研究的酒曲样品细菌群落组成。每个样品的Chao 1指数和Shannon指数用于评估物种丰度和多样性[14]。通过计算样品的多样性指数发现，酒曲A和酒曲C的Chao 1指数和Shannon指数明显高于酒曲B，这说明酒曲A和酒曲C中的物种丰度明显高于酒曲B，且酒曲A和酒曲C的细菌群落结构比较复杂。由图1可知，随着测序深度的增加物种的数量也随之增加，但与此同时每个样品的Shannon曲线已进入平台期[15]。由此可知，虽然随着测序量的增加有可能会发现新的细菌种系型，但样品细菌多样性已经不再随测序量的增加而发生变化，说明测序数量足够充分合理[16]。因此，本研究细菌的测序量满足后续的生物信息学分析要求。