《表4 酒曲样品真菌测序数据统计分析》
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《应用Illumina高通量测序技术分析3种酒曲中微生物多样性》
酒曲A、B、C经过测序后得出3种酒曲样品中共获得60 945条高质量真菌序列(表4),3种酒曲中获得有效序列相同,均为20 315条,基于97%相似度,其OTU数量分别为2.4、1和15.8。ACE指数在0~16.09之间,Shannon指数在0.06~1.06之间,Chao 1指数在5.5~25之间,覆盖率均为99.99%。说明所测得的OTU基本能反映所研究酒曲样品真菌群落组成。通过计算样品的多样性指数发现,酒曲A的Chao 1指数25最大,说明酒曲A的真菌微生物丰度高于酒曲B和酒曲C。在多样性方面,酒曲C的Shannon指数1.06最大,说明酒曲C的真菌群落结构较为复杂。由图4可知,随着测序深度的增加,发现物种的数量也随之增加,与此同时,每个样品的Shannon曲线己进入平台期。由此可知,虽然随着测序量的增加有可能会发现新的真菌种系型,但样品真菌的多样性己经不再随测序量的增加而发生变化。因此,本研究真菌的测序量满足后续的生物信息学分析要求。
图表编号 | XD0075174000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.25 |
作者 | 母应春、姜丽、苏伟 |
绘制单位 | 贵州大学酿酒与食品工程学院、贵州大学酿酒与食品工程学院、贵州大学酿酒与食品工程学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |