《表4 各组瘤胃液细菌高通量测序质量控制与样品多样性指数》

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《饲粮中添加沙葱粉或复合益生菌制剂对杜寒杂交羊瘤胃发酵参数和瘤胃液菌群多样性的影响》

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本试验测序样品为12个，所有样品的平均读长为253 bp。由表4可知，各组去除嵌合体之后的Clean reads数分别为:对照组，81 597条；沙葱组，82 952条；复合益生菌组，93 805条。复合益生菌组的Clean reads数显著高于对照组和沙葱组（P<0.05）。为了研究样品的物种组成多样性，对所有样品的Clean reads进行聚类，以97%的一致性，将序列聚类成OTUs，对照组、沙葱组和复合益生菌组的OTUs数分别为622、616和842个，复合益生菌组显著高于对照组和沙葱组（P<0.05）。测序覆盖率均为0.998 3，满足后续测序分析。与对照组相比，复合益生菌组香农指数显著升高（P<0.05），而沙葱组香农指数虽高于对照组，但差异不显著（P>0.05）。香农指数反映瘤胃菌群的多样性，数值越大，表明细菌多样性越丰富，因此通过3组之间香农指数的比较证明沙葱组和复合益生菌组瘤胃具有更丰富的菌群多样性。此外，复合益生菌组Chao1指数显著高于对照组和沙葱组（P<0.05）。在瘤胃液细菌高通量测序质量控制与样品多样性指数中，复合益生菌组的Clean reads数、OTUs数、香农指数和Chao1指数均显著高于对照组和沙葱组（P<0.05），而沙葱组和对照组之间各指标差异不显著（P>0.05）。