《表1 细菌多样性指数表:基于高通量测序对中国不同区域传统发酵香肠细菌多样性的研究》

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《基于高通量测序对中国不同区域传统发酵香肠细菌多样性的研究》


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注:相同地区之间不同字母表示具有显著性差异(P<0.05)。

Alpha多样性是指一个特定区域或者生态系统内的多样性,常用的度量标准有Sobs、Chao1、Shannon和Simpson指数。Sobs是用来表示丰富度实际观测值的指标,Chao1指数是生态学中用来估计物种总数的常用指数。Shannon指数越大,说明群落多样性越高;Simpson指数越小,说明群落多样性和均匀性越高[18]。4个不同地区之间发酵香肠细菌多样性指数如表1所示。在四川地区中,A5组的Sobs(160.33±2.08)、Shannon(2.10±0.25)和Chao1(197.47±2.32)指数要明显大于其他4组(P<0.05),Simpson指数要明显小于其他4组(P<0.05),A5组在SC香肠中细菌多样性最丰富。在广东地区中,B3组的Sobs(252.00±4.00)、Chao1(266.79±4.32)和Shannon(3.22±0.06)指数要明显大于其他4组(P<0.05),B3组Simpson(0.11±0.01)指数要明显小于其他4组(P<0.05),B3组在GD香肠中细菌多样性最丰富。在湖南地区中,C4组的Sobs(208.66±21.38)指数要明显大于其他4组(P<0.05);Chao1(246.81±25.81)指数要明显大于其他4组(P<0.05),其中C4和C1组之间不存在显著性差异。C1组的Simpson指数要明显小于其他4组(P<0.05),其中C1组和C2组之间不存在显著性差异;C1组的Shannon指数要明显大于其他4组(P<0.05),C4组在HN香肠中细菌多样性最丰富。在哈尔滨地区中,D3组的Sobs指数要明显大于其他4组(P<0.05);Shannon指数要明显大于其他4组(P<0.05),其中D3组和D5组之间不存在显著性差异;Simpson指数要明显小于其他4组(P<0.05),其中D3组和D5组之间不存在显著性差异;Chao1指数也要明显大于其他4组(P<0.05),D3组在HB香肠中细菌多样性最丰富。