《表2 PCR扩增引物及程序》
使用变色硅胶快速干燥叶片材料。每次称取30 mg叶片加入液氮研碎,采用改进后的CTAB法(Doyle and Doyle,1987)提取植物总DNA,使用1%琼脂糖凝胶进行电泳检测。以rbcL、matK、trnL-trnF和ITS2作为扩增目的片段,扩增体系(20μL)为:2μL DNA模板,2.0μL 10×PCR Buffer,2.0μL 25 mmol·L-1MgCl2,1.6μL 2.5 mmol·L-1 dNTPs,0.2μL 5 U·μL-1r Taq,12.2μL ddH2O,10μmol·L-1正反扩增引物各1μL。对扩增或测序失败的样品使用高保真聚合酶(TransTaq HiFi DNA Polymerase)进行重复实验,并调整扩增体系为:2μL DNA模板,2.0μL HiFi Buffer I,1.6μL 2.5 mmol·L-1 dNTPs,0.2μL5 U·μL-1 HiFi DNA Polymerase,14.2μL ddH2O。由于matK片段引物通用性较低,实验中使用matK3-F/matK1R与matK-390F/matK-1326R两对引物(Chen et al.,2010)进行扩增。另外,在matK和ITS2扩增体系中添加BSA和DMSO以提高扩增效率。除此之外,由于ITS2片段有较高的GC/AT含量,在扩增失败的样品反应体系中添加5%GC Enhancer。扩增产物送华大基因(广州华大公司)进行双向测序,扩增引物及反应程序见表2。
图表编号 | XD0064050900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.10 |
作者 | 胡建霖、刘志芳、慈秀芹、李捷 |
绘制单位 | 中国科学院西双版纳热带植物园综合保护中心植物系统发育与保护生物学实验室、中国科学院大学、中国科学院西双版纳热带植物园综合保护中心植物系统发育与保护生物学实验室、中国科学院大学、中国科学院西双版纳热带植物园综合保护中心植物系统发育与保护生物学实验室、中国科学院西双版纳热带植物园综合保护中心植物系统发育与保护生物学实验室 |
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