《表3 紫斑牡丹目的基因SSR标记引物》

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《RNA-seq技术开发紫斑牡丹目的基因SSR标记》

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以调控紫斑牡丹油脂合成和脂肪酸积累、种子大小和粒重、心室数（多角果）、花性别分化、生长发育及角鲨烯等重要性状的相关基因为目的基因，从紫斑牡丹种子RNA-seq转录组数据库查找注释为相应目的基因的Unigenes，统计目的Unigenes上搜索挖掘到的SSR标记。采用Primer 5软件进行SSR引物设计，设计的引物SSR位点序列长度≥50 bp，并对每一个SSR位点分别设计三组引物供选用。所设计的引物（表3）特征为:（1）长度在15～25 bp范围内；（2）PCR扩增产物长度为100～400 bp；（3）退火温度（Tm值）在50℃～60℃之间；（4）GC的含量在40%～60%；（5）避免出现发夹结构及引物二聚体等。