《表5 刺五加目的基因SSR引物信息》
以皂苷、维生素、SOD、鞣质、脂肪酸、糖和酸等为目的性状,利用转录组数据中的Unigenes功能注释,筛选与上述性状相关的目的基因,包括与皂苷合成相关的SS(Squalene synthase)、HMGR(3-hydroxy-3-methylglutarylcoenzymeA)、SE(Squaleneepoxidase)、DXPS(1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase)和OSCs(Epoxy squalene cyclase)基因(邢朝斌等,2012;2014),与脂肪酸合成相关的ACC(Acetyl-coA carboxylase)、KASⅡ(3-ketoacyl-ACP-synthaseⅡ)、KASⅢ(3-ketoacyl-ACP-synthaseⅢ)、FATB(Fatty acyl-ACP thioesterase B)、FATA(Fatty acyl-ACP thioesterase A)、SAD(Stearoyl desaturase)、FAD2(Delta-12 desaturase)、GPAT(Glycerol-3-phosphate acyltransferase)、DGAT(Diacylglycerol acyltransferase)和KCS(3-ketoacyl-CoA synthase)基因,与糖酸合成相关的Fructose-bisphosphate aldolase、Citrate synthase、Malate dehydrogenase、Phosphoenolpyruvate carboxylase、Alpha-amylase、Glucosidase、Sucrose synthase、Neutral invertase、Pectinesterase、Polygalacturonase基因,与维生素合成有关的TC(Tocopherol cyclase)、GDP-mannose pyrophosphorylase和Myo-inositol oxygenase基因(邹礼平等,2012),以及SOD基因。利用Primer 3.0软件设计107对目的基因SSR引物,以刺五加叶片基因组的DNA为模板进行PCR扩增,采用琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物扩增情况,其中56对引物扩增出清晰的目的条带(表4;表5),有效扩增效率为52.33%,部分引物的扩增情况(图2)。
图表编号 | XD0059060200 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.07.28 |
作者 | 李雪柔、丁健、阮成江、周译诠、杨伞伞 |
绘制单位 | 大连民族大学资源植物研究所生物技术与资源利用教育部重点实验室、大连民族大学资源植物研究所生物技术与资源利用教育部重点实验室、大连民族大学资源植物研究所生物技术与资源利用教育部重点实验室、大连民族大学资源植物研究所生物技术与资源利用教育部重点实验室、大连民族大学资源植物研究所生物技术与资源利用教育部重点实验室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |