《表2 用于定性和定量ARGs等目的基因片段的引物基本信息》
对各介质中两种磺胺类ARGs(sul1和sul2)、3种四环素类ARGs(tet W、tet C和tet Q)、两种氯霉素类ARGs(cml A和floR)以及与ARGs传播密切相关的一类整合子intl1进行定量PCR(q PCR)分析.扩增ARGs片段所对应的引物名称、序列、片段大小和退火温度的信息见表2.目的基因的PCR扩增体系设置为30μL,其中包括15μL的q PCR Mix,Mg2+(2 mmol·L-1)溶液2μL,正向和反向引物各0.5μL,模板2μL,模板DNA浓度约为10 ng·μL-1,加dd H2O补足至30μL.PCR扩增设置程序为:在95℃预变性3 min,95℃变性30 s,退火温度为60℃,最后72℃延伸30 s,循环30次.PCR产物通过琼脂糖凝胶电泳跑胶后,割取扩增片段大小正确的条带回收,用于后续的标准品制作.将纯化后的PCR产物连接到p MD19-T载体上,连接载体转化后涂布至LB琼脂平板,在37℃下过夜培养,PCR鉴定5个单克隆菌落,挑选接种一个阳性菌落进行扩大培养,之后进行质粒抽提,即标准品质粒.采用标准品专用稀释液做10倍梯度稀释,制备目的基因的定量标准曲线.
图表编号 | XD00198266200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.02.15 |
作者 | 王龙飞、程逸群、胡晓东、朱金鑫、李轶 |
绘制单位 | 河海大学环境学院浅水湖泊综合治理与资源开发教育部重点实验室、河海大学环境学院浅水湖泊综合治理与资源开发教育部重点实验室、江苏省水利科学研究院、河海大学环境学院浅水湖泊综合治理与资源开发教育部重点实验室、河海大学环境学院浅水湖泊综合治理与资源开发教育部重点实验室 |
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