《表3 重楼目的基因SSR标记引物》

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《高通量RNA-seq技术开发梵净山重楼SSR标记》

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以调控重楼皂苷、黄酮、种子萌发和种子生长发育的相关基因为目的基因，与重楼块根RNA-seq转录组数据库中存在功能注释的Unigenes进行对比分析，获取目的Unigenes上搜索挖掘出的SSR标记。利用Primer 3.0软件设计SSR标记引物（表3），设计的引物SSR位点序列长度必需大于50 bp，且具有以下特征:（1）长度介于18～23 bp之间；（2）PCR扩增产物的长度介于100～300 bp之间；（3）退火温度（Tm值）介于51℃～60℃之间；（4）GC的含量介于51%～64%；（5）避免出现发夹结构及引物二聚体等。