《表1 文冠果引物信息及退火温度》

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《基于SSR标记的文冠果引物筛选及体系优化》


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对每个初步筛出的14对引物,均在其最适退火温度的范围,将琼脂糖凝胶检测的退火温度按1℃的梯度设置,逐一进行退火温度分析,以确定最适退火温度。以引物QXH083为例,经测定其上游引物退火温度为56.9℃,下游引物退火温度为56.1℃,故其检测最适退火温度的范围为54℃~59℃,琼脂糖凝胶检测的退火温度分别设为54℃、55℃、56℃、57℃、58℃、59℃6组。引物QXH083在6组不同退火温度下产物的琼脂糖凝胶检测结果表明,随着退火温度的依次增加,条带的明亮程度呈现先增加后降低的变化,其中56℃时条带最亮,故引物QXH083的最适退火温度为56℃(图5;表1)。