《表3 SRAP引物组合扩增信息分析及最佳退火温度》

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《海南油茶SRAP-PCR体系优化及有效引物筛选》


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注:最佳退火温度为正向引物与方向引物的平均退火温度

基于建立的反应体系对400对SRAP引物组合进行筛选,最终获得191对条带数多且清晰SRAP引物。以3份形态差异大且分布距离较远的海南油茶基因组DNA(ZX-01,琼科优1号和琼科优4号)为模板,对第一次筛选获得的191对引物进行复选。最终筛选出32对条带清晰稳定、差异性大、多态性强引物组合,扩增结果(图5)。32对引物组合进行SRAP-PCR扩增,得到288条带,多态性比率平均值达到74.54%,其中,引物组合ME4-EM1、ME2-EM4、ME5-EM1、ME12-EM3和ME6-EM20的多态性比率均在90.00%以上,多态性比率最小的为引物组合ME12-EM5,为50.00%,平均每对引物扩增9条(表3)。